従業者とするか否かは、給料・賃金の支払いの有無により判断されます。
下請会社から給与が支払われているので、下請会社の従業者となりますが、仮に出向いた先（元請会社）に下請会社の帳簿類があれば、そこに下請会社の事業所があると調査上は扱われるので、その事業所（下請会社の別の事業所）の従業者とします。
なお、帳簿類がなければ、下請会社の中で、その社員を管理している事業所の従業者とします。